供应粮食，粮食转运极其繁重然而登莱地区的陆地交通却极其不便明代，山东布政司共辖六府，地处东部沿海的青州、莱州、登州三府所谓“东三府”，而地处西部运河沿岸的济南、兖州、东昌三府是“西三府”相对而言，东三府地区不论是在交通还是在贸易方面都同西三府存在着较大差距
地处东部沿海的东三府，境内多为丘陵和山地，陆上交通极为不便位于最东部的登州府，三面临海，陆上交通最为闭塞“西境虽连莱（州）、青（州），而阻山界岭，鸟道羊肠，车不能容轨，人不能方辔”，人称“无一线可通之路”这样交通状况无疑极大地阻碍了它与其他地区的商贸流通，所以出现“僻在东隅，阻山环海，地瘠民稀，贸易不通，商贾罕至”的局面
从南方运来得大批的粮食走大运河抵达山东之后，需要陆地转运才能运到登、莱等地而西三府的地理条件使得陆地转运非常之困难因为道路难行，运价也就非常的高昂
朝廷拨给登莱驻军和东江的粮食往往不能很快的运到登州，堆积在临清等地，不但损耗大增，而且牵扯到许多官场上的交道粮食要运到登州，必须要征发民夫，雇佣车辆，沿途要供应吃喝住宿，有时候还得修桥补路这都牵扯到地方官的配合孙元化毕竟只是登莱巡抚，不是山东全省的巡抚，出了自己的管辖范围，做起事情来就不是那么得心应手了为此他不得不在省里和沿线府县做许多的工作，以保证粮食能够顺利的运送
不仅是粮食，其他补给也都存在这样的问题按照现代人的眼光，东三府都是沿海州县，典型的适宜搞“外向型经济”的地区，而且海运条件非常的好――整个东三府海岸线绵延近三千公里，所辖29个州县中，濒海州县占了近60％的比重，早在隋、唐、北宋时期，登州、莱州、胶州即已发展成为中国与国外进行贸易的重要港口
但是由于明初厉行海禁，山东沿海的海上贸易衰落下去了尽管嘉靖之后海禁松弛，民间海运有所恢复，但是规模始终不大，每条船的运力不过数百石，每年到港船只亦不过二三百艘登莱等地依然处于交通不便，物资流通困难的状态之下孙元化每每为此伤脑筋不已
相比之下，其他物资尚且可以走海路运送，唯独这粮食，只要从江南调运的就非走大运河不可――这是体制问题，要改走海道不是他一个人说了算的了――漕运是朝廷的“大政”，就是已经入阁的徐光启都不能左右
赵引弓道：“既然如此，为何不设法就地筹措？就算不能全部解决，至少也能解决一部分，百姓们也得些好处”
孙元化道：“你初来乍到，不知这里的关节所在就说本地的粮食，登莱一带素来土地贫瘠，出产